SOVA (Structural Order Visualization and Analysis tools) は、物質・材料の構造秩序の解析と可視化のためのソフトウェアとなります。
- 様々なファイルフォーマット（xyz, cif, cfgなど）への対応
- 様々なユニット（原子、化学結合、多面体、リング、空隙）の可視化
- 結合角、２体相関関数、構造因子（全構造因子、部分構造因子）の計算・可視化
- リングの列挙、可視化、統計量の計算
- 空隙の計算と可視化
pythonパッケージ（sovapy）は、pipコマンドでDLできます。
exampleなどの詳細は、githubレポジトリをご参照ください。
GUIアプリは以下からDLできます。
- Windows版インストーラー （2025/1/8に更新。sovapyに合わせてversion 0.7.1）
- Mac版インストーラー （2025/1/8に更新。sovapyに合わせてversion 0.7.1）
（Mac版は実行前に、ターミナルで「xattr -rc /Applications/SOVA.app」の実行が必要）
動作の様子は、マニュアル（web版、PDF版）からご確認できます。
（注意：改良を重ねているので、実際の画面と異なる場合があります。）
開発途中のソフトウェアですので、計算結果などを十分に吟味してご活用ください。
バグ報告、コメントなどがあれば、志賀にご連絡ください。
文献の引用：ソフトウェアSOVAの論文を作成中です。解析内容に応じて、以下の引用をお願いします。
リング形状解析の文献
[1] M. Shiga, A. Hirata, Y. Onodera, H. Masai, Ring-originated anisotropy of local structural ordering in amorphous and crystalline silicon dioxide. Commun. Mater. 4, 91 (2023). https://doi.org/10.1038/s43246-023-00416-w
空隙解析の文献
[2] I. Meyer, F. Rhiem, F. Beule, D. Knodt, J. Heinen, R. O. Jones, pyMolDyn: Identification, structure, and properties of cavities/vacancies in condensed matter, J. Comput. Chem., 38, 389–394 (2017). https://doi.org/10.1002/jcc.24697
注意：作者または著作権者は、契約行為、不法行為、またはそれ以外であろうと、ソフトウェアに起因または関連し、あるいはソフトウェアの使用またはその他の扱いによって生じる一切の請求、損害、その他の義務について何らの責任も負わないものとします。
謝辞：科研費・学術変革領域（A)「超秩序構造科学が創造する物性科学」の支援を受けています。